Struktura organizacyjna
W skład Instytutu wchodzą:
- Zakład badawczy ekohydrologii ekosystemów rzecznych i obszarów zurbanizowanych
- Zakład badawczy ekohydrologii molekularnej
Organami Europejskiego Regionalnego Centrum Ekohydrologii PAN są:
- Dyrektor Instytutu
- Rada Naukowa Instytutu.